Российские ДНК-анализаторы помогут создать генетический паспорт лесов
Поставка приборов осуществлена в рамках федерального проекта «Сохранение лесов» национального проекта «Экологическое благополучие». Это первый случай массового внедрения отечественных ДНК-анализаторов в систему лесного мониторинга страны.
Внедрение оборудования проходило в несколько этапов. Специалисты компании-разработчика совместно с сотрудниками Рослесозащиты провели пусконаладочные работы непосредственно в лабораторных условиях, затем для лаборантов и биологов организовали обучение работе с новым оборудованием, включая освоение программного обеспечения и методик интерпретации данных. Только после завершения полного цикла подготовки анализаторы были введены в штатный режим.
«Нанофор 05» представляет собой первый серийный генетический анализатор, полностью разработанный и произведенный в России. Научную основу для его создания обеспечил Институт аналитического приборостроения Российской академии наук. Устройство оснащено восемью высокоточными капиллярами, что позволяет одновременно выполнять как секвенирование ДНК, так и фрагментный анализ. По сравнению с ранее использовавшимися однокапиллярными системами, новая модель обеспечивает восьмикратное увеличение пропускной способности. Это означает, что лаборатории теперь могут обрабатывать в восемь раз больше образцов за то же время, что важно для масштабного мониторинга лесных ресурсов.
Cеквенирование – это расшифровка последовательности нуклеотидов в молекуле ДНК, своего рода «чтение» генетического кода любого организма. Фрагментный анализ, в свою очередь, изучает микросателлитные повторы, короткие участки ДНК, которые уникальны для каждого вида и даже отдельной популяции. Эти маркеры можно сравнить с генетическими «отпечатками пальцев» деревьев. Их исследование позволяет ученым определять популяционную структуру, оценивать генетическое разнообразие лесных массивов и выявлять редкие или уникальные популяции, нуждающиеся в охране.
Главная цель модернизации приборной базы – это создание единой референсной базы генетических данных всех лесообразующих пород России. Она станет основой для эффективного мониторинга состояния лесов, контроля происхождения посадочного материала, выявления незаконных рубок и сохранения биоразнообразия.