ООПТ Новосибирской области имеют важное значение с научной точки зрения для исследования и сохранения естественных экосистем и ландшафтов, мониторинга региональных и глобальных изменений биосферы, а также изучения и сохранения биоразнообразия региона. Функционирование и развитие сети ООПТ на территории области способствует сохранению редких и находящихся под угрозой исчезновения видов животных, растений и грибов, внесенных в Красные книги Новосибирской области и Российской Федерации.

В систему ООПТ Новосибирской области вошли ценные природные комплексы (лесные, речные, болотные, озерные, степные) и ландшафты, места произрастания (обитания) редких и находящихся под угрозой исчезновения видов растений, животных и грибов.

На 31 декабря 2020 года на территории области функционировало 84 ООПТ, общей площадью 1747,5 тыс. га или 9,3 % от общей площади региона.

В зависимости от назначения и режима особой охраны в Новосибирской области действуют следующие ООПТ:

- государственный природный заповедник «Васюганский»;

- государственный природный заказник федерального значения «Кирзинский»;

- Дендрологический сад Новосибирской зональной плодово-ягодной опытной станции им. И.В. Мичурина;

- Центральный сибирский ботанический сад Сибирского отделения Российской академии наук;

- 24 государственных природных заказника регионального значения;

- 54 памятника природы регионального значения;

- 2 ООПТ местного значения: особо охраняемая природная территория местного значения «Городской парк «Бердская коса» г. Бердска Новосибирской области и особо охраняемая природная территория местного значения в районе ул. Репина г. Бердска– городской парк.

В расчет доли общей площади ООПТ в общей площади Новосибирской области не включена территория особо охраняемой природной территории регионального значения - государственного природного заказника «Северный» Новосибирской области, более 80% территории которого в конце 2017 года вошло в границы государственного природного заповедника «Васюганский».

Для справки:

В настоящий момент в России насчитывается почти 13 тысяч ООПТ федерального, регионального и местного значения. Особо охраняемых природных территорий федерального значения – 237, в том числе – 109 государственных природных заповедников, 65 национальных парков, 63 государственных природных заказника. Из них в ведении Минприроды России находятся 230 ООПТ, включая 105 государственных природных заповедников, 63 национальных парка и 62 государственных природных заказников федерального значения. В управлении иных ведомств (Минобрнауки России, ФСО России, Управление делами Президента Российской Федерации, ГК "Росатом") находится 7 ООПТ: 4 государственных природных заповедника, 2 национальных парка и 1 государственный природный заказник федерального значения.